Эдо никогда не спит!

Группа исследователей под руководством профессора Ксавьера прекращает свою деятельность после серии неудач на научных конкурсах. Участники коллектива принимают решение расформировать команду из-за отсутствия возможности продолжать работу над важными проектами.

Вскоре после этого события над Японией нависает угроза, способная распространиться на весь мир и привести к гибели человечества. Для предотвращения катастрофы требуется мобилизация всех доступных ресурсов. В критический момент появляется отряд людей со сверхъестественными способностями, называющих себя Людьми Икс. Эти индивиды берутся за решение проблемы, воспринимая её как возможность для применения своих навыков.